Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MsmbO08540 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MsmbO08540 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MsmbO08540 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MsmbO08540 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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