Protein–RNA interactions for Protein: K7N724

Gm3453, Predicted gene 3453, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3453K7N724 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3453K7N724 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3453K7N724 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms