Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r39G3UWE6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r39G3UWE6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r39G3UWE6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r39G3UWE6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r39G3UWE6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r39G3UWE6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r39G3UWE6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r39G3UWE6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r39G3UWE6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r39G3UWE6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms