Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28038F7BCN9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Gm28038F7BCN9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm28038F7BCN9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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