Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20538F6Z9R1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms