Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M11F6U8V3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M11F6U8V3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M11F6U8V3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms