Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FancfE9Q5Z5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancfE9Q5Z5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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