Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5415E9PXF3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5415E9PXF3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5415E9PXF3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms