Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trabd2bB1ATG9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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