Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spocd1B1ASB6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms