Protein–RNA interactions for Protein: A9Z055

H2al2b, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al2bA9Z055 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2al2bA9Z055 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms