Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ism1A2ATD1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms