Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SktA2AQ25 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SktA2AQ25 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms