Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms