Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms