Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms