Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Rab5aQ9CQD1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Rab5aQ9CQD1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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