Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms