Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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