Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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