Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PUM3Q15397 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PUM3Q15397 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PUM3Q15397 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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PUM3Q15397 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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PUM3Q15397 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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