Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms