Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rdh8D3Z6W3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rdh8D3Z6W3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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