Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ribc2Q9D4Q1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms