Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SkilQ60665 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkilQ60665 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms