Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA9P57773 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA9P57773 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms