Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TtrP07309 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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TtrP07309 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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TtrP07309 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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TtrP07309 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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TtrP07309 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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TtrP07309 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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TtrP07309 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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TtrP07309 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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TtrP07309 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TtrP07309 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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TtrP07309 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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TtrP07309 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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TtrP07309 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TtrP07309 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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