Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmco5aQ9D9D5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms