Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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