Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms