Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms