Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms