Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF1P10914 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF1P10914 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms