Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms