Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIOO75962 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms