Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms