Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trim68Q8K243 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trim68Q8K243 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trim68Q8K243 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trim68Q8K243 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trim68Q8K243 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim68Q8K243 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trim68Q8K243 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms