Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms