Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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