Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms