Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18526 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18526 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18526 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18526 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18526 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms