Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms