Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms