Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms