Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms