Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms