Protein–RNA interactions for Protein: Q9D659

Vsir, V-type immunoglobulin domain-containing suppressor of T-cell activation, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VsirQ9D659 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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VsirQ9D659 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VsirQ9D659 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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VsirQ9D659 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VsirQ9D659 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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VsirQ9D659 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VsirQ9D659 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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VsirQ9D659 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VsirQ9D659 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VsirQ9D659 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VsirQ9D659 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VsirQ9D659 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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