Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms