Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms