Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp17leQ7M764 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms